KG
急危重症多组学知识图谱
TraumaDataCenter · v9 · PubMed 摘要全文抽取
急危重症医学知识图谱

基于 175.27.158.13 服务器 2.37M 篇 PubMed 摘要全文抽取，跨 19 类节点、7 类关系，自动从基因、蛋白、药物、代谢物、微生物到临床结局的多维证据链路。

N
节点总数
 
19 类生物学实体
E
关系总数
 
7 类因果方向
D
疾病库
 
个专科疾病
P
覆盖文献
 
PubMed 摘要
L
数据生成
 
v8_incremental_parallel
L1–L9 + 新组学 层节点分布气泡图
横轴 = 节点类型，纵轴 = 文献覆盖数（log），气泡 = 出现频次。新增 L10 蛋白质组、L11 微生物组、L12 表观组 等多组学类型。
节点类型构成
19 类生物医学实体的总文献覆盖数（包含 6 类新组学：蛋白质组、代谢物、微生物、表观组、转录组）
节点类型覆盖明细 (BubbleData / W2)
按节点类型 × 链层 × 总出现次数 —— 含 6 类新增组学
热门疾病 (Top 12)
点击进入疾病图谱钻取
按连通度排序的疾病 (Top 12)
按节点度数 (Degree) 排序，反映该疾病在跨层证据图中的连通强度
关系类型分布
OHDSI OMOP CDM 7 类关系
知识图谱 / —

—

—

节点数 — 边数 — 涉及文献 — 证据强度 —
正在加载疾病图谱数据…
疾病核心节点 (Top 30)
按出现频次排序
关系类型构成
按边数排序
节点类型分布
L1–L12 跨层关联（含新组学层）
L1–L9 流量视图 (Sankey)
按病种筛选跨层实体流量 · ?disease=sepsis&limit=200
最低证据等级
high moderate low very_low conflict solid=sufficient dashed=correlational dotted=co-occurs
GRADE 高质量证据 (Top Edges)
来自 /ai-clone/api/kg/evidence_links · 默认 evidence≥high + causal_strength≥sufficient · GRADE 9 维向量已就绪 (G6-3)
最低 evidence_level
最低 causal_strength
limit
证据样本 (Top 5)
从摘要全文抽取的高频证据句
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数据源: PubMed 摘要全文 (2.37M) · expert_knowledge.db (含 omics_* 6 类新组学表) · 服务器 175.27.158.13 · 构建版本 kg_nodes v8 + omics_extraction_v1 (2026-07-11)
多组学联合共现分析
按疾病锚点显示 2/3/4/5-层组交集、方向极性与证据样本 — L1-L9 跨层关联，不只 2 节点流
① 双层 (Layer Pair) 共现矩阵 色块 = +/− 方向比例；透明度 = 边密度；点击单元格查看证据样本
② k-层组 (Layer Set) PMID 计数 横向柱 = 出现该层组组合的 PMID 数；圆点 = 层组成员
③ 跨层通路 (Layer k-Path) 按图中 k 值显示 — 每条链路为有向路径 ≥k 个不同层；显示极性 + 关系类型